Lipoprotein (a) se vyskytuje ve stěnách tepen a může mít atherogenitální efekt. Protože je jeho struktura podobná plasminogenu, může také zabránit fibrinolýze a proto se chovat thrombogenně. Nadměrná koncentrace Lp(a) v séru, upozorňuje na zvýšené nebezpečí atherosklerózy a infarktu. V kombinaci se zvýšenou hladinou LDL Cholesterolu, se riziko infarktu zvyšuje přibližně šestkrát.